応用例としては、アパレル系サイトなどがあげられる。
別サイト内包型の構造は、違った方向性をもっカテゴリで構成されたサイトでよく見られるパターンである。 Webサイトの目的によっては、カテゴリごとに各ページを別サイトであるかのように見せることで、ユーザーに異なるアプローチをさせたほうがよい場合もある。別サイト内包型構造の特徴は、ページがカテゴリごとに分類されていて、階層化されたひとつの塊を個別のサイトとして扱うことで、サイト内包を実現している点だ。そのため、本来であれば横断できるはずの他カテゴリへのリンクを意図的に排除し、サイト内で動きを循環させるよう
に促している。ファッションブランド、を多数保持しているアパレル系サイトなどでは、効果的に使うことで違いをアピールできる。